تهدف مصلحة الطب الشرعى أولا وأخيراً إلى تحقيق العداله ورفع الظلم بإستخدام العلوم الطبية الشرعية و الجنائيه المختلفة، ولتحقيق ذلك تحرص مصلحة الطب الشرعى على الأهداف الآتية:
تتطلع مصلحة الطب الشرعى إلى الحصول على أحدث وأجود الأجهزة فى
مجال الطب الشرعى لمواكبة التطور السريع فى علم كشف الجريمة
رفع المستوى العلمى لأطباء وخبراء مصلحة الطب الشرعى وتنمية
مهاراتهم المهنية، و توفير بيئة عمل أفضل
تطبيق معايير الجودة فى أداء العمل وإختيار الكيماويات والأدوات
المساعده لضمان أعلى مستويات خدمات الطب الشرعى